Le système Reiki crée par Mikao Usui trouve ses racines dans différents courants dont le bouddhisme, le taoisme, le Shintô et le Shugendô. " Shugendô" veut dire "la voie du magicien". Il s'agit d'une forme de bouddhisme populaire. Cette voie est essentiellement pratiqué par les ascètes et les moines. L'ascète se retire dans les montagnes et effectue des rituels, pratique des formules magiques, fait des offrandes aux divinités et étudie les sûtra. Les ascètes pratiquent sur le Mont Kurama, un mont sur lequel Mikao Usui fit sa retraite spirituelle qui le mena à l'éveil. Mikao Usui fut certainement influencé par la pratique du Shugendô grâce à la rencontre des ascètes.
Parmi ces ascètes et moines, il est important de citer le moine le plus célèbre du Japon, Kûkai ( 774-835). Ce moine a diffusé les enseignements du bouddhisme ésotérique au Japon. Cette forme de bouddhisme requiert de suivre les enseignements du Bouddha suprême, Dainichi Nyorai. La pratique consiste à pratiquer la méditation et à transmettre l'énergie dans le but de guérir les maladies, aider les gens a trouver du bonheur dans leur vie et les guider vers l'éveil ou l'illumination.
Toute personne initiée au système Reiki est reliée au Bouddha suprême, Dainichi Nyorai. Nous pouvons nous "connecter" avec le symbole HS à ce Bouddha afin de soutenir notre pratique Reiki.